Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC148Q8NFR7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms