Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C17orf47Q8NEP4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms