Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRN4CLQ8ND94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRN4CLQ8ND94 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms