Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RDH13Q8NBN7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RDH13Q8NBN7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RDH13Q8NBN7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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RDH13Q8NBN7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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