Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NHLRC2Q8NBF2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NHLRC2Q8NBF2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms