Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LTBP4Q8N2S1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LTBP4Q8N2S1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms