Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLASRPQ8N2M8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLASRPQ8N2M8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms