Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDHDQ86WU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDHDQ86WU2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms