Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
PBRM1Q86U86 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PBRM1Q86U86 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms