Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX29Q7Z478 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DHX29Q7Z478 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms