Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC4Q7Z404 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC4Q7Z404 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms