Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRINP3Q76B58 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRINP3Q76B58 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms