Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms