Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q71RC1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q71RC1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q71RC1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q71RC1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q71RC1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms