Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TPGS1Q6ZTW0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TPGS1Q6ZTW0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms