Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRC9Q6ZRR7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC9Q6ZRR7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms