Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SUSD1Q6UWL2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms