Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
METAP1DQ6UB28 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
METAP1DQ6UB28 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms