Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBED9Q6R2W3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms