Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms