Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LRRC8EQ6NSJ5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms