Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LEMD1Q68G75 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LEMD1Q68G75 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms