Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AGAP6Q5VW22 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AGAP6Q5VW22 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms