Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF38BQ5VTL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRPF38BQ5VTL8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms