Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GFI1BQ5VTD9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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