Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAMD5Q5TGI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms