Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIF1Q5T3J3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRIF1Q5T3J3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms