Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP70Q5T0N1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP70Q5T0N1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms