Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CEP170Q5SW79 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CEP170Q5SW79 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms