Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SDK2Q58EX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDK2Q58EX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms