Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KHDC3LQ587J8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms