Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q56UQ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q56UQ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms