Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COBLL1Q53SF7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COBLL1Q53SF7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms