Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYTL3Q4VX76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms