Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ISXQ2M1V0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms