Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFX7Q2KHR2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX7Q2KHR2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms