Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms