Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC142Q17RM4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms