Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IMPG1Q17R60 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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