Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2SQ16763 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2SQ16763 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms