Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA2Q15822 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA2Q15822 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms