Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCOA1Q15788 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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NCOA1Q15788 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
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NCOA1Q15788 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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NCOA1Q15788 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
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NCOA1Q15788 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
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NCOA1Q15788 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCOA1Q15788 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
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