Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3B3Q15393 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SF3B3Q15393 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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