Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF4Q15306 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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