Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRKQ15262 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRKQ15262 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms