Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDK1Q15118 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDK1Q15118 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms