Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BRD3Q15059 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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BRD3Q15059 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRD3Q15059 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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