Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSME4Q14997 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME4Q14997 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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