Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MDC1Q14676 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MDC1Q14676 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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