Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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GBX1Q14549 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GBX1Q14549 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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GBX1Q14549 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GBX1Q14549 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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